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4. 髓母细胞瘤基于神经递质受体的分子亚型特异性转录调控图谱

日期:2024-08-27 点击数: 来源:

髓母细胞瘤(medulloblastomas,MB)是儿童中最常见的恶性脑肿瘤,占所有儿童脑肿瘤的15%至25%。脑部特殊的环境决定了MB的生长受到血脑屏障、复杂的神经元细胞和免疫细胞相互作用等多种肿瘤微环境因素的调控,是其疗效不佳、预后较差的重要因素之一。由于传统的转录组测序并不能有效测量支配不同基因表达的调控机制,且目前髓母细胞瘤的分型仍局限于甲基化分类,临床上缺乏高特异性的转录组和蛋白组生物标记。因此,阐明MB的分子亚型标志物及其调控将为MB的治疗策略提供新的参考。本研究首次绘制了人类MB各亚型的单细胞染色质可及性图谱(Chromatin accessibility),联合snATAC-seq与scRNA-seq MB数据集,团队发现MB细胞中存在广泛的突触合成基因表达,基于神经递质受体(NTR genes)基因特征集表达的队列分型与甲基化金标准几乎一致(准确性>98%),这为肿瘤分类提供了新的生物标记。体外和体内的基因敲除实验证明NTR基因的敲除能够抑制相应分子亚型的肿瘤细胞增殖。本研究证实了TF-NTR网络可作为MB分子分型的依据,发现神经递质信号受体分子参与了髓母细胞瘤的增殖的功能,为髓母细胞瘤的分子分型和对应治疗提供了新依据(Advanced Science2024)。

上一条:3. 代谢物作为“信号分子”调控表调控免疫细胞Treg的功能和机制